Podczas stosowania izotretynoiny mogą pojawiać się bóle mięśni, szczególnie w przypadku intensywnego wysiłku fizycznego. Z tego powodu zaleca się ograniczenie ćwiczeń na siłowni.

Ból pleców występuje najczęściej u osób poniżej 16 roku życia. Podobnie jak większość pozostałych objawów jest on zależny od dawki leku. W przypadku bardzo nasilonych dolegliwości lekarz może zmniejszyć dawkę lub zalecić przyjmowanie leków niesterydowych leków przeciwzapalnych (warunkiem jest prawidłowy poziom transaminaz).