Przyczyną uszkodzenia skóry właściwej i powstawania blizn zanikowych w przebiegu trądziku są głębokie zmiany zapalne o charakterze guzów i torbieli. Miejscowe ubytki skóry właściwej są zastępowane przez tkankę łączną włóknistą.

Izotretynoina poprzez hamowanie maetaloproteinaz – enzymów odpowiedzialnych m.in. za rozpad kolagenu, zapobiega powstawaniu blizn zanikowych, które są częstym następstwem głębokich, naciekowych postaci trądziku. Zaobserwowano, że podczas przyjmowania izotretynoiny spłyceniu ulegają istniejące blizny zanikowe.